Decidir cuándo realizar las determinaciones dependerá de cómo cambien  las  concentraciones  de  contaminantes  del  aire  en  el tiempo. La contaminación puede detectarse inicialmente por la mañana, durante la jornada de trabajo o al final del día; puede detectarse  al  comienzo  o  al  final  de  la  semana;  durante  el invierno o el verano; cuando el aire acondicionado está conectado o desconectado; o bien en otros momentos.
Para abordar estos aspectos correctamente, debe conocerse la dinámica del ambiente interior en cuestión. También es necesario conocer el objetivo de las muestras, que se basará en los tipos de contaminantes que interese investigar. En la dinámica del ambiente interior influyen la diversidad y variabilidad de las fuentes de contaminación, las diferencias físicas de los espacios estudiados, el tipo de compartimentación, el tipo de ventilación y climatización utilizada, las condiciones atmosféricas exteriores
(viento,  temperatura,  estación,  etc.)  y  las  características  del edificio (número de ventanas, su orientación, etc.).
Los objetivos de las determinaciones definirán si la toma de muestras se llevará a cabo durante intervalos de tiempo cortos o largos. Si se cree que los efectos de los contaminantes en cuestión  sobre  la  salud  son  prolongados,  deberán  determinarse  las concentraciones  promedio  durante  períodos  largos  de  tiempo.
Para  las  sustancias  con  efectos  agudos  pero  no  acumulativos, bastará  realizar  determinaciones  durante  períodos  cortos  de tiempo. Si se sospechan emisiones intensas de corta duración, se requerirán   tomas   de   muestras   frecuentes   durante   períodos cortos para detectar el tiempo de emisión. Con todo, no debe olvidarse que en muchos casos las opciones para utilizar uno u otro  tipo  de  método  de  toma  de  muestras  depende  de  los métodos analíticos disponibles o exigidos.
Si después de considerar todas estas cuestiones no está suficientemente claro cuál es el origen del problema, o cuándo tiene lugar con mayor frecuencia, la decisión con respecto a cuándo y dónde  tomar  muestras  deberá  realizarse  al  azar,  calculando  el número de muestras en función de la fiabilidad y los costes de las mismas.
 
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